WinHex jest wysokiej klasy edytorem analizującym i modyfikującym różne dane, od danych na dysku poprzez dostęp do pamięci fizycznej RAM, czy też analizę i porównywanie plików zapisanych w różnych formatach. Aplikacja daje możliwość pracy w trybie szesnastkowym, gdzie umożliwia konwersję między trybami: binarnym, hex ASCII, Intel Hex, oraz Motorola S. Dzięki WinHex użytkownik może m.in odzyskiwać dane. Aplikacja obsługuje partycje: FAT12/16/32, exFAT, NTFS, Ext2/3/4, Next3, CDFS, UDF, umożliwia szyfrowanie w systemie AES 256 bit. Prócz wymienionych, WinHex oferuje szereg innych zaawansowanych funkcji.